GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| MNYL557 | KENEVİR BİYOTEKNOLOJİSİ VE MOLEKÜLER MARKER UYGULAMALARI | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
1- Kenevir genetik temeli hakkında bilgi edinimi. 2- Endüstriyel kenevirde moleküler markör uygulamaları hakkında bilgi edinilmesi. 3- Moleküler belirteç araçları kullanılarak bazı önemli özelliklerin belirlenmesi. (Cinsiyet tayini veya kenevir türü). 4- Endüstriyel kenevir için fonksiyonel genomiği hakkında bilgi edinimi. 5- Kenevir mutasyonları hakkında bilgi edinimi
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Dr. Öğr. Üye Ahmad ALSALEH
Öğrenme Çıktıları
| 1 | 1- Kenevirin genetik temeli hakkında bilgi sahibi olunması. |
| 2 | 2- Moleküler markörün endüstriyel kenevir uygulamaları hakkında bilgi sahibi olunması. |
| 3 | 3- Moleküler markör araçları kullanılarak bazı önemli özelliklerin belirlenmesi (Cinsiyet veya kenevir türü). |
| 4 | 4- Endüstriyel kenevirin fonksiyonel genomiği hakkında bilgi sahibi olunması. |
| 5 | 5- Kenevirin mutasyon türleri hakkında bilgi sahibi olmak. |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
[Yok]
Dersin İçeriği
Giriş: Kenevir Genetiği ve kenevir bilimlerinde moleküler markör uygulamaları Moleküler genetik çeşitlilik. Moleküler markörlerin sınıflandırılması Kısa Tandem Tekrarlar (STRs) Markörleri. Basit Dizi Tekrarı (SSRs) Markörleri. Basit Tekrarları Dizi Arası (ISSRs) Markörleri Sekansı Karakterize Edilmiş Çoğaltılmış Bölgeler Dizileme ile Genotiplemeye giriş Tüm genom shotgun (WGS) analizi. Yüksek verimli floresan bazlı markör sistemi Organel genomu Kloroplast genomu Kenevirde omik çalışmaları Fonksiyonel genomik Kenevirde mutasyon türleri
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Giriş: Kenevir Genetiği ve kenevir bilimlerinde moleküler markör uygulamaları | ||
| 2 | Moleküler genetik çeşitlilik. | ||
| 3 | Kenevir DNA İzolasyonu DNA Isolation of hemp | ||
| 4 | Moleküler markörlerin sınıflandırılması | ||
| 5 | Kısa Tandem Tekrarlar (STRs) Markörleri. Basit Dizi Tekrarı (SSRs) Markörleri. | ||
| 6 | Basit Tekrarları Dizi Arası (ISSRs) Markörleri Jel puanlama ve yorumlama | ||
| 7 | Sekansı Karakterize Edilmiş Çoğaltılmış Bölgeler ISSR analizi uygulamaları | ||
| 8 | Dizileme ile Genotiplemeye giriş Ara sınav | ||
| 9 | Tüm genom shotgun (WGS) analizi. SCAR markörü kullanarak cinsiyet tayini | ||
| 10 | Yüksek verimli floresan bazlı markör sistemi Jel puanlama ve yorumlama | ||
| 11 | Organel genomu Kloroplast genomu SCAR markörü kullanarak kemotip kalıtımı | ||
| 12 | Kenevirde omik çalışmaları HRM analizi | ||
| 13 | Fonksiyonel genomik HRM analizi | ||
| 14 | Kenevirde mutasyon türleri |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1. Jacob A. Toth, George M. Stack, Ali R. Cala, Craig H. Carlson, Rebecca L. Wilk, Jamie L. Crawford, Donald R. Viands, Glenn Philippe, Christine D. Smart, Jocelyn K. C. Rose, Lawrence B. Smart (2020) Development and validation of genetic markers for sex and cannabinoid chemotype in Cannabis sativa L. GCB Bioenergy. 2020;12:213–222. 2. G. Mandolino · A. Carboni · S. Forapani V. Faeti · P. Ranalli (1999) Identification of DNA markers linked to the male sex in dioecious hemp (Cannabis sativa L.) Theor Appl Genet (1999) 98 : 86—92 3. Otto Törjek , Nandor Bucherna , Erzsebet Kiss, Hajnalka Homoki, Zsuzsanna Finta-Korpelova, Ivan Bocsa , Istvan Nagy & Laszl o E. Heszky (2002) Novel male-specific molecular markers (MADC5, MADC6) in hemp. Euphytica 127: 209–218, 2002. 4. G. Mandolino & A. Carboni (2004) Potential of marker-assisted selection in hemp genetic improvement. Euphytica 140: 107–120, 2004. 5. Daniela Pacifico, Francesca Miselli, Mirta Micheler, Andrea Carboni, Paolo Ranalli and Giuseppe Mandolino (2006) Genetics and marker-assisted selection of the chemotype in Cannabis sativa L. Molecular Breeding (2006) 17: 257–268. DOI 10.1007/s11032-005-5681-x 6. Ryan C. Lynch, Daniela Vergara, Silas Tittes, Kristin White, C. J. Schwartz, Matthew J. Gibbs, Travis C. Ruthenburg, Kymron deCesare, Donald P. Land & Nolan C. Kane (2016) Genomic and Chemical Diversity in Cannabis, Critical Reviews in Plant Sciences, 35:5-6, 349-363, DOI: 10.1080/07352689.2016.1265363 7. Peter Mendel, Ajınkya Bharat Lalge, Tomas Vyhnanek, Vaclav Trojan, Petr Kalousek , Hugo Maassen, Ladıslav Havel (2016) Progress In Early Sex Determınatıon Of Cannabıs Plant By Dna Markers. Mendelnet P: 731-735, 2016 8. Chiara Onofri and Giuseppe Mandolino (2017) Genomics and Molecular Markers in Cannabis sativa L. Chapter 15 , p: 319-338, DOI 10.1007/978-3-319-54564-6_15 9. Dersi veren öğretim üyesinin ders notları, önerilen kaynak kitaplar
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 60 |
| Uygulama/Pratik | 1 | 40 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 1 | 1 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Uygulama/Pratik | 5 | 1 | 5 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 3 | 42 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 6 | 3 | 18 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 6 | 3 | 18 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 128 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| ÖÇ 2 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| ÖÇ 3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| ÖÇ 4 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| ÖÇ 5 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 | 4 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek