GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| MNYL557 | KENEVİR BİYOTEKNOLOJİSİ VE MOLEKÜLER MARKER UYGULAMALARI | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 1 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
1- Kenevir genetik temeli hakkında bilgi edinimi. 2- Endüstriyel kenevirde moleküler markör uygulamaları hakkında bilgi edinilmesi. 3- Moleküler belirteç araçları kullanılarak bazı önemli özelliklerin belirlenmesi. (Cinsiyet tayini veya kenevir türü). 4- Endüstriyel kenevir için fonksiyonel genomiği hakkında bilgi edinimi. 5- Kenevir mutasyonları hakkında bilgi edinimi
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Doç. Dr. Ahmad ALSALEH
Öğrenme Çıktıları
| 1 | 1- Kenevirin genetik temeli hakkında bilgi sahibi olunması. |
| 2 | 2- Moleküler markörün endüstriyel kenevir uygulamaları hakkında bilgi sahibi olunması. |
| 3 | 3- Moleküler markör araçları kullanılarak bazı önemli özelliklerin belirlenmesi (Cinsiyet veya kenevir türü). |
| 4 | 4- Endüstriyel kenevirin fonksiyonel genomiği hakkında bilgi sahibi olunması. |
| 5 | 5- Kenevirin mutasyon türleri hakkında bilgi sahibi olmak. |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
[Yok]
Dersin İçeriği
Giriş: Kenevir Genetiği ve kenevir bilimlerinde moleküler markör uygulamaları Moleküler genetik çeşitlilik. Moleküler markörlerin sınıflandırılması Kısa Tandem Tekrarlar (STRs) Markörleri. Basit Dizi Tekrarı (SSRs) Markörleri. Basit Tekrarları Dizi Arası (ISSRs) Markörleri Sekansı Karakterize Edilmiş Çoğaltılmış Bölgeler Dizileme ile Genotiplemeye giriş Tüm genom shotgun (WGS) analizi. Yüksek verimli floresan bazlı markör sistemi Organel genomu Kloroplast genomu Kenevirde omik çalışmaları Fonksiyonel genomik Kenevirde mutasyon türleri
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Giriş: Kenevir Genetiği ve kenevir bilimlerinde moleküler markör uygulamaları | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği | |
| 2 | Moleküler genetik çeşitlilik. | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği | |
| 3 | Kenevir DNA İzolasyonu DNA Isolation of hemp | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği | |
| 4 | Moleküler markörlerin sınıflandırılması | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği | |
| 5 | Kısa Tandem Tekrarlar (STRs) Markörleri. Basit Dizi Tekrarı (SSRs) Markörleri. | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği | |
| 6 | Basit Tekrarları Dizi Arası (ISSRs) Markörleri Jel puanlama ve yorumlama | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği | |
| 7 | Sekansı Karakterize Edilmiş Çoğaltılmış Bölgeler ISSR analizi uygulamaları | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği | |
| 8 | Dizileme ile Genotiplemeye giriş Ara sınav | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği | |
| 9 | Tüm genom shotgun (WGS) analizi. SCAR markörü kullanarak cinsiyet tayini | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği | |
| 10 | Yüksek verimli floresan bazlı markör sistemi Jel puanlama ve yorumlama | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği | |
| 11 | Organel genomu Kloroplast genomu SCAR markörü kullanarak kemotip kalıtımı | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği | |
| 12 | Kenevirde omik çalışmaları HRM analizi | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği | |
| 13 | Fonksiyonel genomik HRM analizi | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği | |
| 14 | Kenevirde mutasyon türleri | Anlatım Yöntemi, Tartışma Yöntemi, Soru - Cevap Tekniği |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1. Jacob A. Toth, George M. Stack, Ali R. Cala, Craig H. Carlson, Rebecca L. Wilk, Jamie L. Crawford, Donald R. Viands, Glenn Philippe, Christine D. Smart, Jocelyn K. C. Rose, Lawrence B. Smart (2020) Development and validation of genetic markers for sex and cannabinoid chemotype in Cannabis sativa L. GCB Bioenergy. 2020;12:213–222. 2. G. Mandolino · A. Carboni · S. Forapani V. Faeti · P. Ranalli (1999) Identification of DNA markers linked to the male sex in dioecious hemp (Cannabis sativa L.) Theor Appl Genet (1999) 98 : 86—92 3. Otto Törjek , Nandor Bucherna , Erzsebet Kiss, Hajnalka Homoki, Zsuzsanna Finta-Korpelova, Ivan Bocsa , Istvan Nagy & Laszl o E. Heszky (2002) Novel male-specific molecular markers (MADC5, MADC6) in hemp. Euphytica 127: 209–218, 2002. 4. G. Mandolino & A. Carboni (2004) Potential of marker-assisted selection in hemp genetic improvement. Euphytica 140: 107–120, 2004. 5. Daniela Pacifico, Francesca Miselli, Mirta Micheler, Andrea Carboni, Paolo Ranalli and Giuseppe Mandolino (2006) Genetics and marker-assisted selection of the chemotype in Cannabis sativa L. Molecular Breeding (2006) 17: 257–268. DOI 10.1007/s11032-005-5681-x 6. Ryan C. Lynch, Daniela Vergara, Silas Tittes, Kristin White, C. J. Schwartz, Matthew J. Gibbs, Travis C. Ruthenburg, Kymron deCesare, Donald P. Land & Nolan C. Kane (2016) Genomic and Chemical Diversity in Cannabis, Critical Reviews in Plant Sciences, 35:5-6, 349-363, DOI: 10.1080/07352689.2016.1265363 7. Peter Mendel, Ajınkya Bharat Lalge, Tomas Vyhnanek, Vaclav Trojan, Petr Kalousek , Hugo Maassen, Ladıslav Havel (2016) Progress In Early Sex Determınatıon Of Cannabıs Plant By Dna Markers. Mendelnet P: 731-735, 2016 8. Chiara Onofri and Giuseppe Mandolino (2017) Genomics and Molecular Markers in Cannabis sativa L. Chapter 15 , p: 319-338, DOI 10.1007/978-3-319-54564-6_15 9. Dersi veren öğretim üyesinin ders notları, önerilen kaynak kitaplar
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 40 |
| Makale Kritik Etme | 1 | 40 |
| Ev Ödevi | 1 | 20 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 2 | 28 |
| Tartışma | 1 | 3 | 3 |
| Rapor Hazırlama | 2 | 3 | 6 |
| Rapor Sunma | 2 | 2 | 4 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 2 | 28 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 10 | 10 |
| Okuma | 12 | 3 | 36 |
| Rapor | 1 | 3 | 3 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 120 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | |
| ÖÇ 1 | 4 | 5 | |||||||||||||
| ÖÇ 2 | 5 | 5 | |||||||||||||
| ÖÇ 3 | 4 | 4 | |||||||||||||
| ÖÇ 4 | 4 | ||||||||||||||
| ÖÇ 5 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek