GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| TBYL563 | BAKTERİLERİN TEŞHİS VE TANISINDA KULLANILAN YÖNTEMLER | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 1 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu ders kapsamında bitki dokularından, su, toprak, hava gibi çevresel örneklerden elde edilen patojenik ve/veya biyolojik mücadelede kullanılabilecek patojen olmayan izolatların kültürlerinin klasik, serolojik ve moleküler testlerle uygulamalı olarak tür/alt tür teşhis ve tanısından izlenmesi gereken yollar işlenecektir. Herhangi bir örnekten izolasyon sonucundan gelişen bakteriyel kültürlerin kullanım olanaklarının ve sistematikteki yerinin farklı analizlerle kombine olarak belirlenmesi hedeflenmektedir.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Doç. Dr. Murat ÖZTÜRK
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Bitki patojeni bakterilerin izolasyonu ve cins düzeyinde morfolojik özelliklerini öğrenmek |
| 2 | Biyokimyasal testler ile ön tanılama ve fizyolojik testleri öğrenmek |
| 3 | Patovar ve ırk kavramlarına göre patojenisite testlerini öğrenmek |
| 4 | Moleküler tanı çalışmalarının bakteriyel sistematikteki önemini öğrenme |
| 5 | Hastalıklı bitki materyalinden doğrudan bakteriyel etmenlerin tanılanmasını öğrenmek |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yoktur
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yoktur
Dersin İçeriği
Bitki patojeni bakterilerin tanılanmasında kullanılan yöntemleri kapsamaktadır
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Klasik testler (Gram boyama, KOH testi) | sunum ve tartışma tekniği | yoktur |
| 2 | Serolojik testler | sunum ve tartışma tekniği | yoktur |
| 3 | Moleküler testler | sunum ve tartışma tekniği | yoktur |
| 4 | DNA izolasyonu | sunum ve tartışma tekniği | yoktur |
| 5 | DNA yoğunluğu tayini ve PCR için template hazırlanması | sunum ve tartışma tekniği | yoktur |
| 6 | Agaroz jel hazırlanması | sunum ve tartışma tekniği | yoktur |
| 7 | DNA’ya dayalı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) | sunum ve tartışma tekniği | yoktur |
| 8 | Elektroforez jel koşturmas | sunum ve tartışma tekniği | yoktur |
| 9 | Protein izolasyonu | sunum ve tartışma tekniği | yoktur |
| 10 | SDS-PAGE poliakrilamid jel elektroforez | sunum ve tartışma tekniği | yoktur |
| 11 | Tütünde aşırın duyarlılık testi | sunum ve tartışma tekniği | yoktur |
| 12 | Tür ve alt tür tanısı yapılan izolatların kullanım olanaklarının değerlendirilmesi | sunum ve tartışma tekniği | yoktur |
| 13 | Filogenetk analizler | sunum ve tartışma tekniği | yoktur |
| 14 | Ders değerlendirme | tartışma tekniği | yoktur |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Slayt sunumları Lacy, G. H., & Lukezic, F. L. (2004). Laboratory exercises for plant pathogenic bacteria. Plant Pathology, Concepts and Laboratory Exercises, 13(4), 53-60. Schaad, N. W. (Ed.). (1981). Laboratory guide for identification of plant pathogenic bacteria (pp. 72-pp).
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yoktur
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Quiz | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 5 | 4 | 20 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 7 | 6 | 42 |
| Quiz için Bireysel Çalışma | 1 | 4 | 4 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 114 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 5 | |||||||||||||
| ÖÇ 2 | 5 | 5 | 3 | 5 | 3 | 5 | 4 | 5 | 4 | 3 | 4 | ||||
| ÖÇ 3 | 5 | 5 | 4 | ||||||||||||
| ÖÇ 4 | 5 | 4 | 4 | 3 | 5 | 3 | 4 | 5 | |||||||
| ÖÇ 5 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek