GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BBYL567 | BİTKİLERDE GEN EKSPRESYONU VE REGÜLASYONU | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Dersin Amacı
Bu ders, öğrencilerin bitkilerde gen ekspresyonu mekanizmalarını kavramasını, transkripsiyonda görev alan proteinlerin işlevlerini anlamasını, mRNA'ların modifikasyon, degradasyon ve hücre içi lokalizasyon gibi post-transkripsiyonel süreçleri öğrenmesini, gen susturma mekanizmalarını kavramasını ve bitkilerde gen ekspresyonunun düzenlenmesi ile analizine dair temel bilgi ve beceriler kazanmasını amaçlamaktadır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Doç. Dr. Müjgan GÜNEY
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Bitkilerde gen ekspresyonu süreçlerini açıklayabilme. |
| 2 | Transkripsiyonla ilgili proteinleri tanıyıp görevlerini belirleyebilme. |
| 3 | mRNA’nın modifikasyon ve taşınma süreçlerini açıklayabilme. |
| 4 | Gen susturma mekanizmalarını (RNAi, epigenetik vb.) kavrayabilme. |
| 5 | Gen ekspresyonunu analiz etmeye yönelik temel yöntemleri kullanabilme. |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Ön koşul yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yoktur.
Dersin İçeriği
Bitkilerde gen ekspresyonu mekanizmaları, transkripsiyon süreçlerinde görev alan proteinler, mRNA’nın modifikasyonu, degradasyonu ve hücre içi taşınımı, gen susturma (RNAi, epigenetik) mekanizmaları ile gen ekspresyonunun düzenlenmesi ve analiz yöntemlerine (RT-qPCR, RNA-Seq vb.) yönelik temel bilgiler; bu süreçlerin bahçe bitkileri ıslahındaki uygulama ve önemine yönelik bilgiler.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Ders tanıtımı, gen ekspresyonuna giriş, DNA–RNA–protein ilişkisi | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
| 2 | Bitkilerde genetik materyalin organizasyonu ve kromatin yapısı | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
| 3 | Transkripsiyonun temelleri: RNA polimeraz ve promotör bölgeler | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
| 4 | Transkripsiyon faktörleri: Temel, aktivatör ve baskılayıcı proteinler | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
| 5 | Kromatin modifikasyonları ve epigenetik düzenleme mekanizmaları. | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
| 6 | mRNA modifikasyonları: 5’ kaplama, poli-A kuyruğu, splicing | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
| 7 | mRNA'nın hücre içi taşınımı ve stabilitesi | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
| 8 | Gen susturma mekanizmaları I: RNAi ve mikroRNA’lar | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
| 9 | Gen susturma mekanizmaları II: Epigenetik yollar | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
| 10 | Gen ekspresyon analiz teknikleri I: RT-qPCR ve Northern blot | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
| 11 | Gen ekspresyon analiz teknikleri II: RNA-Seq ve veri analizi | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
| 12 | Genomik verilerin biyoinformatik araçlarla değerlendirilmesi | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
| 13 | Gen ekspresyonunun bahçe bitkileri ıslahında kullanımı | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
| 14 | Genel değerlendirme | Ders kapsamında anlatım, soru-cevap, tartışma, problem çözme, bireysel ve grup sunumları gibi öğretim yöntem ve teknikleri kullanılacaktır. | Yoktur. |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1. Hartl, D. L., & Jones, E. W. (2014). Genetik: İlkeler ve Analiz (Çev. Ed. Mehmet Özkan). Palme Yayıncılık. 2. Güncel makaleler
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 40 |
| Ev Ödevi | 1 | 60 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yoktur.
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 2 | 2 |
| Final Sınavı | 1 | 2 | 2 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Tartışma | 10 | 1 | 10 |
| Beyin Fırtınası | 5 | 1 | 5 |
| Makale Kritik Etme | 10 | 1 | 10 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 1 | 14 |
| Ödev Problemleri için Bireysel Çalışma | 1 | 6 | 6 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 5 | 5 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 8 | 8 |
| Okuma | 5 | 2 | 10 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 114 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 3 | |||||||||
| ÖÇ 2 | 5 | 3 | |||||||||
| ÖÇ 3 | 5 | 3 | |||||||||
| ÖÇ 4 | 5 | 3 | |||||||||
| ÖÇ 5 | 5 | 3 | 4 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek