GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BBYL566 | BİYOİNFORMATİĞE GİRİŞ | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Temel biyoinformatik uygulamalar hakkında bilgiler vermek
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Doç. Dr. Müjgan GÜNEY
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Temel biyoinformatik terimlerini kavrayabilme |
| 2 | Gen bankaları kullanabilme |
| 3 | Biyoinformatik için paket programları kullanabilme |
| 4 | Biyolojik araştırmalarda kullanılan yöntemleri öğrenebilme, problemleri analiz edip çözebilme |
| 5 | Moleküler genetikte temel biyoinformatik analizleri yapabilme |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Bu dersin ön koşulu yoktur.
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Bu ders, biyoenformatiğin temel kavramlarını ve bahçe bitkilerinde kullanım alanlarını içermektedir. Genom analizi ve dizileme teknolojileri (Sanger, NGS, RNA-seq) ile bitki genomları veri tabanlarına giriş yapmayı öğrecncilere aktarmayı hedeflemektedir. Ayrıca, genomik veri işleme, veri görselleştirme, gen anotasyonu, varyant analizi ve filogenetik analiz gibi ileri konularıda içermektedir. Metabolik yolak analizleri ve fonksiyonel gen çalışmaları gibi biyoenformatik araçları kullanarak analiz öğretmeyi yapmalarını hedeflemektedir.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Dersin tanımı, tarihçesi, dersle ilgili genel bilgiler | Anlatım (Düz Anlatım) Tekniği ve Soru-Cevap Tekniği | Yok |
| 2 | DNA ve RNA dizilerinin İncelenmesi | Anlatım (Düz Anlatım) Tekniği ve Soru-Cevap Tekniği | Yok |
| 3 | Bigi ağı nedir ve kullanım alanları | Anlatım (Düz Anlatım) Tekniği ve Soru-Cevap Tekniği | Yok |
| 4 | Biyoinformatikte veri tabanları | Anlatım (Düz Anlatım) Tekniği ve Soru-Cevap Tekniği | Yok |
| 5 | Nükleotit veri tabanlarının kullanımı | Anlatım (Düz Anlatım) Tekniği ve Soru-Cevap Tekniği | Yok |
| 6 | Protein ve özel dizi veri tabanlarının kullanımı | Anlatım (Düz Anlatım) Tekniği ve Soru-Cevap Tekniği | Yok |
| 7 | Filogenide biyoinformatik | Anlatım (Düz Anlatım) Tekniği ve Soru-Cevap Tekniği | Yok |
| 8 | DNA dizi analizlerinin incelenmesinde ileri teknikler | Anlatım (Düz Anlatım) Tekniği ve Soru-Cevap Tekniği | Yok |
| 9 | İki dizinin karşılaştırılması | Anlatım (Düz Anlatım) Tekniği ve Soru-Cevap Tekniği | Yok |
| 10 | Çoklu dizi hizalanması | Anlatım (Düz Anlatım) Tekniği ve Soru-Cevap Tekniği | Yok |
| 11 | Hizalamaların düzenlenmesi ve yayımlanması | Anlatım (Düz Anlatım) Tekniği ve Soru-Cevap Tekniği | Yok |
| 12 | İleri biyoinformatik teknikler | Anlatım (Düz Anlatım) Tekniği ve Soru-Cevap Tekniği | Yok |
| 13 | Bazı biyoinformatik kaynakların tanıtılması | Anlatım (Düz Anlatım) Tekniği ve Soru-Cevap Tekniği | Yok |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
1. Barnes, M.R. “Bioinformatics for Geneticists”, John Wiley& Sons Lts., (2007). 2. Lesk, A.M “Introduction to Bioinformatics”, Oxford University Press, (2002). 3. https://www.nobelyayin.com/biyologlar-icin-biyoenformatik-bio-informatics-for-biologists-4090.html
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 40 |
| Ev Ödevi | 2 | 60 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 40 |
| Seminer | 1 | 60 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 60 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 40 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 6 | 6 |
| Derse Katılım | 14 | 3 | 42 |
| Uygulama/Pratik | 4 | 5 | 20 |
| Seminer | 2 | 10 | 20 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 1 | 6 | 6 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 1 | 6 | 6 |
| Ev Ödevi | 2 | 12 | 24 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 124 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | |
| ÖÇ 1 | 4 | 3 | |||||||||
| ÖÇ 2 | 3 | ||||||||||
| ÖÇ 3 | 3 | ||||||||||
| ÖÇ 4 | 4 | 5 | 4 | ||||||||
| ÖÇ 5 | 5 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek