GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| KIMS3605 | PROTEİNLERİN SAFLAŞTIRILMASI | Seçmeli Ders Grubu | 3 | 6 | 4,00 |
Dersin Seviyesi
Lisans
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı, proteinlerin biyokimyasal özelliklerini dikkate alarak saflaştırma tekniklerini öğretmek, kromatografi, elektroforez ve çöktürme yöntemlerini teorik ve uygulamalı olarak ele almaktır.
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Prof. Dr. Mustafa SAÇMACI
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Proteinlerin temel yapısını ve fizikokimyasal özelliklerini tanımlar. |
| 2 | Farklı saflaştırma yöntemlerinin prensiplerini açıklar. |
| 3 | Kromatografik teknikleri saflaştırma amacıyla yorumlar ve seçer. |
| 4 | Elektroforez gibi ayırma tekniklerinin uygulamalarını değerlendirir. |
| 5 | Saflaştırma verimliliğini analiz eder. |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Proteinlerin yapısı ve özellikleri, saflaştırma prensipleri, tampon sistemleri, tuzla çöktürme, izoelektrik noktaya göre çöktürme, jel filtrasyonu, iyon değişim kromatografisi, affinite kromatografisi, elektroforetik yöntemler, saflaştırma verimliliği ve analiz teknikleri.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Proteinlerin yapısı ve sınıflandırılması | Anlatım, molekül modeli tanıtımı | Proteinlerin yapısı ve sınıflandırması ile ilgili temel bilgiler okunmalıdır. |
| 2 | Saflaştırma stratejilerine giriş | Kavramsal tartışma, strateji örnekleri | Saflaştırma yaklaşımları hakkında kısa bir literatür taraması yapılmalıdır. |
| 3 | Protein çöktürme teknikleri | Anlatım, reaksiyon eşleştirme etkinliği | Farklı çöktürme yöntemleri ile ilgili örnekler hazırlanmalıdır. |
| 4 | Tuzla çöktürme ve izoelektrik çöktürme | Tartışma, şema çizimi | Tuzla çöktürme ve izoelektrik nokta kavramları gözden geçirilmelidir. |
| 5 | Tampon çözeltiler ve pH kontrolü | Uygulamalı pH hesaplamaları, deney senaryoları | Tampon çözeltiler ve pKa ilişkileri çalışılmalıdır. |
| 6 | Jel filtrasyon kromatografisi | Slayt sunumu, teknik analiz | Jel filtrasyon prensipleri ve kolon şemaları incelenmelidir. |
| 7 | İyon değişim kromatografisi | Problem çözümü, çizim uygulaması | İyon değişim reçineleri ve yük ayrım mekanizmaları araştırılmalıdır. |
| 8 | Affinite kromatografisi | Grup sunumu, vaka analizi | Affinite etkileşimleri ve ligand-protein eşleşmeleri gözden geçirilmelidir. |
| 9 | Yüksek basınçlı sıvı kromatografisi (HPLC) | Anlatım, cihaz tanıtımı | HPLC sistemleri ve dedektör çeşitleri hakkında bilgi toplanmalıdır. |
| 10 | SDS-PAGE ve elektroforetik analiz | Video analizi, bant yorumu | SDS-PAGE yönteminin aşamaları ve bant yorumları çalışılmalıdır. |
| 11 | Saflaştırma adımlarının verimlilik değerlendirmesi | Etkileşimli grafik analizi, örnek hesaplama | Saflaştırma verimliliği hesaplama örnekleri çözülmelidir. |
| 12 | Protein saflık analiz yöntemleri | Literatür taraması, teknik karşılaştırma | Saflık analizi yöntemleri karşılaştırmalı olarak incelenmelidir. |
| 13 | Uygulamalı örnek incelemeleri ve vaka analizleri | Uygulama sunumu, değerlendirme tartışması | Vaka örneklerinde kullanılan teknikler analiz edilmelidir. |
| 14 | Genel tekrar ve öğrenci sunumları | Öğrenci sunumları, genel tekrar | Tüm konular tekrar edilmeli, bireysel sunumlar hazırlanmalıdır. |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Scopes, R. K. (1994). Protein Saflaştırma: Prensipler ve Uygulamalar. Nobel Yayınları. Walker, J. M. (2002). Protein Purification Protocols. Humana Press. Öğretim elemanı tarafından sağlanacak güncel makaleler.
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 50 |
| Quiz | 1 | 50 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ara Sınav | 1 | 1 | 1 |
| Final Sınavı | 1 | 1 | 1 |
| Quiz | 1 | 1 | 1 |
| Derse Katılım | 14 | 2 | 28 |
| Bireysel Çalışma | 14 | 3 | 42 |
| Ara Sınav İçin Bireysel Çalışma | 3 | 3 | 9 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 4 | 4 | 16 |
| Quiz için Bireysel Çalışma | 2 | 2 | 4 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 102 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | |
| ÖÇ 1 | 3 | 2 | 5 | 2 | |||||||||||
| ÖÇ 2 | 3 | 2 | 5 | 2 | |||||||||||
| ÖÇ 3 | 3 | 2 | 5 | 2 | |||||||||||
| ÖÇ 4 | 3 | 2 | 5 | 2 | |||||||||||
| ÖÇ 5 | 3 | 2 | 5 | 2 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek