GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BDR618 | FONKSİYONEL GENOMİKS | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Doktora
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Bu dersin amacı çeşitli model organizmalarda genom yapısının karşılaştırılarak öğrenilmesi, fonksiyonel genomik, ve protein protein etkileşimi, postranslasyonel proteomik uygulamaların literatür eşliğinde tartışılarak kavranması
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Farklı canlılardaki genomik yapıların karşılaştırmalı genomik yaklaşım ile ayırt edebilir |
| 2 | Genomik uygulamalarda kullanılan yöntemler ile genomik uygulama alanlarını kavrar |
| 3 | Klasik ve son proteomik yaklaşımlar ile protein yapısını karşılaştırır |
| 4 | Proteomik yaklaşımlarını tanımlar |
| 5 | Protein yapı ve fonksiyonlarının araştırmasını yapar. |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Genomik’in tanımı ve uygulama şekli, yapısal genomik, işlevsel genomik ve karşılaştırmalı genomiklerin kullanım alanı, canlılara ait genomların analizi, proteomik’in tanımı ve uygulama şekilleri hakkında bilgiler edinilecektir.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Genomik’in tanımı ve uygulama şekli | ||
| 2 | Yapısal, işlevsel ve karşılaştırmalı genomiklerin kullanım alanı | ||
| 3 | Öbakter, Arkea, protista, mantar, bitki ve hayvanlara ait genomların analizi | ||
| 4 | Öbakter, Arkea, protista, mantar, bitki ve hayvanlara ait genomların analizi | ||
| 5 | Mikroarray Verilerinin Bioinformatiği ve Değerlendirilmesi | ||
| 6 | Genomların nükleotit benzerliklerinden yararlanılarak incelenmesi | ||
| 7 | İnsan genomunun bize söyledikleri ve diğer memeli genomları | ||
| 8 | Genom projeleri ve genomları tamamlanmış organizmalara örnekler | ||
| 9 | Fonksiyonel Proteomiks | ||
| 10 | Proteinlerin 3 Boyutlu (3D) yapısı, bir proteinin şekliişlevini ortaya çıkarabilir mi? | ||
| 11 | Protein etkileşimleri | ||
| 12 | Proteinlerin bilişimsel analizleri; Protein veritabanları, Protein Motif ve Domainleri | ||
| 13 | Proteomik ve Genomiksin faydaları | ||
| 14 | Protein Analiz yöntemleri | ||
| 15 | YARIYIL SONU SINAVI |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Genomics: Essential Methods, Mike Starkey (Editor), Ramnath Elaswarapu (Editor), Wiley-Blackwell; 1 edition, 2004.Genomics: Applications in Human Biology Sandy B. Primrose (Author), Richard Twyman (Author), Wiley-Blackwell; 1 edition, February 9, 2004.Introducing Proteomics: From concepts to sample preparation, mass spectrometry and data analysis, josip Lovric, Wiley-Blackwell, 2011Proteomics in Practice: A guide to successful experimental design. Reiner Westermeier, Tom Naxen, Hans-Rudolf Höpker, Wiley-VCH, 2008
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Quiz | 3 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Final Sınavı | 1 | 4 | 4 |
| Quiz | 3 | 1 | 3 |
| Derse Katılım | 14 | 4 | 56 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 20 | 2 | 40 |
| Quiz için Bireysel Çalışma | 10 | 2 | 20 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 123 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | PÇ 16 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 3 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | |||||||||
| ÖÇ 2 | 5 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 2 | |||||||||
| ÖÇ 3 | 5 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 2 | |||||||||
| ÖÇ 4 | 5 | 3 | 4 | 3 | 4 | 3 | 2 | |||||||||
| ÖÇ 5 | 5 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 2 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek