GERİ DÖN
Ders Öğretim Planı
| Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BDR614 | DNA MARKIRLARI ve UYGULAMALARI | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 2 | 5,00 |
Dersin Seviyesi
Doktora
Dersin Sunulduğu Dil
Türkçe
Dersin Amacı
Moleküler markır tekniklerinin prensip, tespit ve kullanımlarının değerlendirilmesi
Dersi Veren Öğretim Görevlisi/Görevlileri
İlgili Öğretim Üyesi
Öğrenme Çıktıları
| 1 | Markır tiplerini ve kullanım amaçlarını bilir |
| 2 | Haritalama populasyonlarını geliştirir ve bu populasyonları kullanarak istenilen genleri manipüle edebilir |
| 3 | PCR tekniklerini bilir ve uygulayabilir |
| 4 | QTL analizini bilir |
| 5 | Moleküler markır tekniklerinin bitki ıslahında uygulanmasını yapabilir |
Öğretim Sistemi
Birinci Öğretim
Dersin Ön Koşulu Olan Dersler
Yok
Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar
Yok
Dersin İçeriği
Moleküler markır teknolojileri ve kullanımları, haritalama populasyonlarının geliştirilmesi ve kullanımı, genetik ve fiziki haritalama teknikleri, PCR metotları, QTL analizi, moleküler tekniklerin bitki ıslahında kullanımını, genom sekanslanması ve karşılaştırmalı genomiks, moleküler ıslahta kullanılan enzim ve vektörler.
Haftalık Ayrıntılı Ders İçeriği
| Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
|---|---|---|---|
| 1 | Giriş materyali; genetik markırlar, özellikleri, sınıflandırılmaları, kullanımları | ||
| 2 | Protein esaslı markırlar; proteinlerin yapıları, görülen varyasyonlar bunların kaynakları, izoenzimler, allozimler, tohum depo proteinleri, özellikleri tespitleri | ||
| 3 | DNA yapısı, reptitif DNA ve bunlarda varyasyonlar, bu varyasyonların markır olarak kullanımları | ||
| 4 | Hibridizasyon esaslı DNA markırları; RFLP’ler | ||
| 5 | Hibridizasyon esaslı DNA markırları; multilokus RFLP problarıyla tepit edilen markırlar | ||
| 6 | Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) ve uygulamaları | ||
| 7 | PCR esaslı DNA markırları; RAPD, DAF, AP-PCR | ||
| 8 | PCR esaslı DNA markırları; AFLP | ||
| 9 | PCR esaslı DNA markırları; ISSR, SAMPL | ||
| 10 | PCR esaslı DNA markırları; SSR (STMS) | ||
| 11 | PCR esaslı DNA markırları; PCR-RFLP (CAPS), SCAR, STS | ||
| 12 | PCR esaslı DNA markırları; SNP, SCCP ve DNA sekansı | ||
| 13 | DNA markırlarının kullanımları ve markır tekniklerinin mukayesesi | ||
| 14 | YARIYIL SONU SINAVI |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
K. Weising, H. Nybom DNA Fingerprinting in Plants and Fungi
Planlanan Öğrenme Aktiviteleri ve Metodları
Değerlendirme
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
|---|---|---|
| Quiz | 3 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
| Final Sınavı | 1 | 100 |
| Toplam | 100 | |
| Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
| Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 | |
Staj Durumu
Yok
İş Yükü Hesaplaması
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Final Sınavı | 1 | 4 | 4 |
| Quiz | 3 | 1 | 3 |
| Derse Katılım | 14 | 4 | 56 |
| Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 20 | 2 | 40 |
| Quiz için Bireysel Çalışma | 10 | 2 | 20 |
| Toplam İş Yükü (saat) | 123 | ||
Program ve Öğrenme Çıktıları İlişkisi
| PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | PÇ 16 | |
| ÖÇ 1 | 5 | 4 | 3 | 2 | 3 | |||||||||||
| ÖÇ 2 | 5 | 4 | 3 | 2 | 3 | |||||||||||
| ÖÇ 3 | 5 | 4 | 4 | 3 | 5 | 2 | 3 | |||||||||
| ÖÇ 4 | 5 | 4 | 3 | 5 | 3 | 3 | ||||||||||
| ÖÇ 5 | 5 | 4 | 4 | 3 | 5 | 2 | 3 |
* Katkı Düzeyi : 1 Çok düşük 2 Düşük 3 Orta 4 Yüksek 5 Çok yüksek