Dersin Kodu | Dersin Adı | Dersin Türü | Yıl | Yarıyıl | AKTS |
---|---|---|---|---|---|
BİY616 | FONSİYONEL GENOMİKS | Seçmeli Ders Grubu | 1 | 1 | 6,00 |
Doktora
Türkçe
Bu dersin amacı çeşitli model organizmalarda genom yapısının karşılaştırılarak öğrenilmesi, fonksiyonel genomik, ve protein protein etkileşimi, postranslasyonel proteomik uygulamaların literatür eşliğinde tartışılarak kavranması
1 | Farklı canlılardaki genomik yapıların karşılaştırmalı genomik yaklaşım ile ayırt edilmesi |
2 | Genomik uygulamalarda kullanılan yöntemler ile genomik uygulama alanlarının kavranabilinmesi |
3 | Klasik ve son proteomik yaklaşımlar ile protein yapısının karşılaştırılması |
4 | Proteomik yaklaşımların tanımlanması |
5 | protein yapı ve fonksiyonlarının araştırılması |
Birinci Öğretim
Yok
Yok
Genomik’in tanımı ve uygulama şekli, yapısal genomik, işlevsel genomik ve karşılaştırmalı genomiklerin kullanım alanı, canlılara ait genomların analizi, proteomik’in tanımı ve uygulama şekilleri hakkında bilgiler edinilecektir.
Hafta | Konular (Teorik) | Öğretim Yöntem ve Teknikleri | Ön Hazırlık |
---|---|---|---|
1 | Genomik’in tanımı ve uygulama şekli | ||
2 | Yapısal, işlevsel ve karşılaştırmalı genomiklerin kullanım alanı | ||
3 | Öbakter, Arkea, protista, mantar, bitki ve hayvanlara ait genomların analizi | ||
4 | Öbakter, Arkea, protista, mantar, bitki ve hayvanlara ait genomların analizi | ||
5 | Mikroarray Verilerinin Bioinformatiği ve Değerlendirilmesi | ||
6 | Genomların nükleotit benzerliklerinden yararlanılarak incelenmesi | ||
7 | İnsan genomunun bize söyledikleri ve diğer memeli genomları | ||
8 | Genom projeleri ve genomları tamamlanmış organizmalara örnekler | ||
9 | Fonksiyonel Proteomiks | ||
10 | Proteinlerin 3 Boyutlu (3D) yapısı, bir proteinin şekliişlevini ortaya çıkarabilir mi? | ||
11 | Protein etkileşimleri | ||
12 | Proteinlerin bilişimsel analizleri; Protein veritabanları, Protein Motif ve Domainleri | ||
13 | Proteomik ve Genomiksin faydaları | ||
14 | Protein Analiz yöntemleri | ||
15 | YARIYIL SONU SINAVI |
Genomics: Essential Methods, Mike Starkey (Editor), Ramnath Elaswarapu (Editor), Wiley-Blackwell; 1 edition, 2004.Genomics: Applications in Human Biology Sandy B. Primrose (Author), Richard Twyman (Author), Wiley-Blackwell; 1 edition, February 9, 2004.Introducing Proteomics: From concepts to sample preparation, mass spectrometry and data analysis, josip Lovric, Wiley-Blackwell, 2011Proteomics in Practice: A guide to successful experimental design. Reiner Westermeier, Tom Naxen, Hans-Rudolf Höpker, Wiley-VCH, 2008
Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | Adet | Değer |
---|---|---|
Quiz | 3 | 100 |
Toplam | 100 | |
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | Adet | Değer |
Final Sınavı | 1 | 100 |
Toplam | 100 | |
Yarıyıl (Yıl) İçi Etkinlikleri | 40 | |
Yarıyıl (Yıl) Sonu Etkinlikleri | 60 |
Yok
Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
---|---|---|---|
Final Sınavı | 1 | 4 | 4 |
Quiz | 3 | 1 | 3 |
Derse Katılım | 14 | 4 | 56 |
Final Sınavı içiin Bireysel Çalışma | 20 | 3 | 60 |
Quiz için Bireysel Çalışma | 10 | 2 | 20 |
Toplam İş Yükü (saat) | 143 |
PÇ 1 | PÇ 2 | PÇ 3 | PÇ 4 | PÇ 5 | PÇ 6 | PÇ 7 | PÇ 8 | PÇ 9 | PÇ 10 | PÇ 11 | PÇ 12 | PÇ 13 | PÇ 14 | PÇ 15 | PÇ 16 | |
ÖÇ 1 | 5 | 3 | 4 | 3 | 4 | 2 | 2 | |||||||||
ÖÇ 2 | 5 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 2 | |||||||||
ÖÇ 3 | 5 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 2 | |||||||||
ÖÇ 4 | 5 | 3 | 4 | 3 | 4 | 3 | 2 | |||||||||
ÖÇ 5 | 5 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 2 |